MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Enterococcus faecium Aus0004 plasmid AUS0004_p3

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017024	TCAA	2	8	30	37	50 %	25 %	0 %	25 %	383315277
2	NC_017024	A	6	6	59	64	100 %	0 %	0 %	0 %	383315277
3	NC_017024	AAC	2	6	66	71	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383315277
4	NC_017024	C	6	6	137	142	0 %	0 %	0 %	100 %	383315277
5	NC_017024	AAATT	2	10	145	154	60 %	40 %	0 %	0 %	383315277
6	NC_017024	GTT	2	6	223	228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383315277
7	NC_017024	ATT	2	6	306	311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383315277
8	NC_017024	ATTC	2	8	429	436	25 %	50 %	0 %	25 %	383315277
9	NC_017024	TTA	2	6	509	514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383315277
10	NC_017024	ACA	2	6	626	631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383315277
11	NC_017024	A	7	7	651	657	100 %	0 %	0 %	0 %	383315277
12	NC_017024	GTG	2	6	684	689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383315277
13	NC_017024	CTG	2	6	785	790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315277
14	NC_017024	ATG	2	6	811	816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383315277
15	NC_017024	AAC	2	6	828	833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383315277
16	NC_017024	ATT	2	6	842	847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383315277
17	NC_017024	AAATAT	2	12	871	882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383315277
18	NC_017024	ATG	2	6	911	916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383315277
19	NC_017024	A	7	7	966	972	100 %	0 %	0 %	0 %	383315277
20	NC_017024	AGG	2	6	1010	1015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383315277
21	NC_017024	TTGG	2	8	1058	1065	0 %	50 %	50 %	0 %	383315278
22	NC_017024	GTT	2	6	1092	1097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383315278
23	NC_017024	T	7	7	1096	1102	0 %	100 %	0 %	0 %	383315278
24	NC_017024	A	7	7	1110	1116	100 %	0 %	0 %	0 %	383315278
25	NC_017024	ATA	2	6	1165	1170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383315278
26	NC_017024	ATT	2	6	1185	1190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383315278
27	NC_017024	AT	3	6	1211	1216	50 %	50 %	0 %	0 %	383315278
28	NC_017024	AGT	2	6	1233	1238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383315278
29	NC_017024	A	6	6	1278	1283	100 %	0 %	0 %	0 %	383315279
30	NC_017024	TGA	2	6	1290	1295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383315279
31	NC_017024	TGG	2	6	1328	1333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383315279
32	NC_017024	AAGAG	2	10	1374	1383	60 %	0 %	40 %	0 %	383315279
33	NC_017024	GAATT	2	10	1394	1403	40 %	40 %	20 %	0 %	383315279
34	NC_017024	ATT	2	6	1424	1429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383315279
35	NC_017024	ATG	2	6	1474	1479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383315279
36	NC_017024	CAAT	2	8	1496	1503	50 %	25 %	0 %	25 %	383315279
37	NC_017024	TTC	2	6	1518	1523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383315279
38	NC_017024	AGA	2	6	1566	1571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383315279
39	NC_017024	TTATG	2	10	1608	1617	20 %	60 %	20 %	0 %	383315279
40	NC_017024	TTAT	2	8	1637	1644	25 %	75 %	0 %	0 %	383315279
41	NC_017024	AAAT	2	8	1647	1654	75 %	25 %	0 %	0 %	383315279
42	NC_017024	AAG	2	6	1709	1714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383315280
43	NC_017024	A	6	6	1723	1728	100 %	0 %	0 %	0 %	383315280
44	NC_017024	A	6	6	1753	1758	100 %	0 %	0 %	0 %	383315280
45	NC_017024	GATT	2	8	1760	1767	25 %	50 %	25 %	0 %	383315280
46	NC_017024	TGA	2	6	1827	1832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383315280
47	NC_017024	GGT	2	6	1841	1846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383315280
48	NC_017024	TGA	2	6	1905	1910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383315280
49	NC_017024	A	7	7	1978	1984	100 %	0 %	0 %	0 %	383315280
50	NC_017024	TGAG	2	8	1991	1998	25 %	25 %	50 %	0 %	383315280
51	NC_017024	TTA	2	6	2230	2235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383315281
52	NC_017024	AGG	2	6	2248	2253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383315281
53	NC_017024	A	6	6	2283	2288	100 %	0 %	0 %	0 %	383315281
54	NC_017024	GAA	2	6	2294	2299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383315281
55	NC_017024	ATA	2	6	2314	2319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383315281
56	NC_017024	ATTT	2	8	2394	2401	25 %	75 %	0 %	0 %	383315281
57	NC_017024	A	6	6	2473	2478	100 %	0 %	0 %	0 %	383315281
58	NC_017024	GAT	2	6	2574	2579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383315281
59	NC_017024	TTC	2	6	2603	2608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383315281
60	NC_017024	ACA	2	6	2624	2629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383315281
61	NC_017024	AG	3	6	2690	2695	50 %	0 %	50 %	0 %	383315281
62	NC_017024	AGC	2	6	2806	2811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315281
63	NC_017024	TAA	2	6	2819	2824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383315281
64	NC_017024	CAA	2	6	2835	2840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383315281
65	NC_017024	AAT	2	6	2880	2885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383315281
66	NC_017024	AAG	2	6	2896	2901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383315281
67	NC_017024	AATG	2	8	2921	2928	50 %	25 %	25 %	0 %	383315281
68	NC_017024	CAA	2	6	2960	2965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383315281
69	NC_017024	A	7	7	3085	3091	100 %	0 %	0 %	0 %	383315281
70	NC_017024	TGG	2	6	3109	3114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383315281
71	NC_017024	GAA	2	6	3135	3140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383315281
72	NC_017024	A	6	6	3144	3149	100 %	0 %	0 %	0 %	383315281
73	NC_017024	GCTG	2	8	3173	3180	0 %	25 %	50 %	25 %	383315281
74	NC_017024	A	6	6	3303	3308	100 %	0 %	0 %	0 %	383315281
75	NC_017024	GAAT	2	8	3323	3330	50 %	25 %	25 %	0 %	383315281
76	NC_017024	T	6	6	3401	3406	0 %	100 %	0 %	0 %	383315281
77	NC_017024	CAA	2	6	3414	3419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383315281
78	NC_017024	GTT	2	6	3438	3443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383315281
79	NC_017024	GAAG	2	8	3461	3468	50 %	0 %	50 %	0 %	383315281
80	NC_017024	ATCA	2	8	3521	3528	50 %	25 %	0 %	25 %	383315281
81	NC_017024	CAG	2	6	3621	3626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315281

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.